酶標儀的分析原理與分光光度法一樣，服從朗伯比爾定律。物質的含量與顯色液的顏色深淺成正比，而顏色深淺可用吸光度表示，所以物質的含量與吸光度值成正比。酶標記抗原或者抗體發生免疫學反應后，與底物的結合物，在特定波長下有大吸收，可通過測定顯色液的吸光度對待測物進行定量。

　　面對類型如此眾多的酶標儀，實驗室在選擇時往往有難以適從的感覺。一般來說，用于酶免疫測定比色的酶標儀可分為普通酶標儀，多功能全自動酶標儀和全自動酶免疫分析系統等，普通酶標儀的功能基本上相當于一個微孔板比色計，而多功能全自動酶標儀除了有微孔板比色功能外，還有酶標動力學，紫外乃至凝集等多種檢測功能；全自動酶免疫分析系統則有試劑“開放”和“限定”之分，所謂試劑“開放”是指不同品牌的ELISA試劑均可用于該儀器，而試劑“限定”則必須使用儀器的酶免測定試劑。

　　實驗室在選擇酶標儀時，一般應遵循這樣幾條原則：

　　1.根據工作需要去選擇

　　切忌刻意去求功能多，因為一則如果儀器功能過多，易出故障，二則有些功能如酶標動力學或凝集等，可能根本就用不上；如果擬購置的酶標儀主要是用于定性測定，則不必要求完美的定量所需的軟件系統。至于全自動酶免疫分析系統則對工作量比較大的血站或大型醫院較為適用，對于日常工作量不太大的實驗室，就無必要。

　　2.根據酶標儀的性能去選擇

　　反應酶標儀性能的指標主要有測定波長范圍，濾光片配置，檢測速度，吸光度范圍，線性范圍，分辨率，準確度，精密度等。

　　3.根據自己實驗室的財力去選擇

　　酶標儀品種類型多，由于性能不一，價格自然也就相差較大，實驗室可根據自己的財力去選擇性能／價格比較為合適的酶標儀。

　　4.根據售后服務去選擇

　　實驗室儀器買了以后，就跟我們家里使用的家用電器一樣，在使用過程中及使用一段時間之后，很可能就會有保修或維修方面的問題，因此一定要選擇售后服務好的公司的酶標儀。